Nel caso di applicazione di sconti contrattuali condizionati, tipicamente il cedente o prestatore emette la fattura senza applicazione dello sconto e, solamente al verificarsi della condizione, emette, su base facoltativa, una nota di variazione IVA in diminuzione. A differenza dell’ipotesi di sopravvenuto accordo tra le parti, se gli sconti sono previsti nelle pattuizioni originarie, la nota di variazione può essere emessa senza limiti temporali, vale a dire anche oltre il termine annuale.